我院本科生伍泳琳、陈虹宇和博士生吕韦玮在国际学术期刊发表研究成果

      12月12日，农学院2019级本科生伍泳琳、陈虹宇和2021级博士生吕韦玮在周潇峰老师的指导下，在国际学术期刊PhytoFrontiers发表了题为“Complete Genome Sequence of Xanthomonas citri subsp. citri CQ13, an Alternative Model Strain to Study Citrus Bacterial Canker in China”的研究论文。

       柑桔溃疡病是一种世界性病害，也是中国柑桔产区重要病害之一。柑橘黄单胞菌是柑橘溃疡病的病原体，由于属于检疫性病害，病原体的模式菌株、质粒等研究材料无法在不同国家与地区间流通，进而阻碍了国内外柑橘溃疡病病原菌研究的一致性和连贯性。该论文首次报道了分离自中国四川富顺地区的柑橘黄单胞菌CQ13菌株的全基因组序列，结合二代和三代测序技术，完成了对CQ13菌株的全基因组组装及注释。结果表明，该菌株基因组包含一个环状染色体（长度为5,142,501 bp，GC含量为64.83%），以及pXAC33、pXAC64两个质粒（长度分别为34,102bp和64,942bp；GC含量分别为61.96%和61.41%），通过注释预测出4,243个编码蛋白基因，53个tRNA、66个rRNA及40个sRNA。进一步通过平均核苷酸相似性、宿主范围、致病性、Ⅲ型分泌系统效应子、毒力蛋白、系统发育等分析发现，CQ13菌株和国外的模式菌株——306菌株在生理学和遗传学特性上高度相似，具有作为306菌株在国内的替代模式菌株的巨大潜力。CQ13菌株的全基因组序列可为国内柑橘溃疡病病原菌研究提供宝贵的参考资源。

       伍泳琳、陈虹宇、吕韦玮同学为该论文的共同第一作者，周潇峰副教授为通讯作者， 2020级本科生葛一菲、2021级研究生刘超颖、2022级研究生丁小军等作为合作作者参与了该项工作。

全文链接：https://doi.org/10.1094/PHYTOFR-11-22-0124-A

（文稿：伍泳琳、陈虹宇、吕韦玮  初审：周潇峰  审核：辛国荣  终审：程月华）